Guía docente de Indicadores Moleculares (M96/56/1/5)

Curso 2023/2024
Fecha de aprobación por la Comisión Académica 19/07/2023

Máster

Máster Universitario en Técnicas y Ciencias de la Calidad del Agua (Idea)

Módulo

Módulo de Técnicas de Biomonitorización y Diseño de Estrategias de Recuperación de Sistemas Acuáticos Sometidos a Estrés

Rama

Ciencias

Centro Responsable del título

International School for Postgraduate Studies

Semestre

Segundo

Créditos

3

Tipo

Optativa

Tipo de enseñanza

Presencial

Profesorado

  • Presentación Carrillo Lechuga
  • Juan Manuel Medina Sánchez
  • Manuel Villar Argáiz

Tutorías

Presentación Carrillo Lechuga

Email
Anual
  • Martes 9:00 a 11:00 (Despacho de la Profesora)
  • Miércoles 9:00 a 11:00 (Despacho de la Profesora)
  • Jueves 9:00 a 11:00 (Despacho de la Profesora)

Juan Manuel Medina Sánchez

Email
Anual
  • Martes 9:00 a 12:00 (Despacho del Profesor)
  • Jueves 9:00 a 12:00 (Despacho del Profesor)

Manuel Villar Argáiz

Email
Anual
  • Jueves 18:00 a 20:00 (Despacho del Profesor)
  • Viernes 10:00 a 14:00 (Despacho del Profesor)

Breve descripción de contenidos (Según memoria de verificación del Máster)

El reciente desarrollo de técnica avanzadas para evaluar el estrés se está revelando de gran utilidad como sistemas de alarma dentro del marco “Ecological Risk Assessment” (ERA). Los métodos basados en expresión génica (proteómica) aparecen particularmente prometedores en términos de economía en su aplicación y de significación de resultados. Por ello, en esta asignatura se estudiarán y analizarán los principales indicadores celulares y subcelulares de estrés ambiental.

Prerrequisitos y/o Recomendaciones

Esta materia no tiene requisitos previos

Competencias

Competencias Básicas

  • CB6. Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación.
  • CB7. Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
  • CB8. Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
  • CB9. Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
  • CB10. Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

Resultados de aprendizaje (Objetivos)

El alumno sabrá/comprenderá:

  • Los principales conceptos sobre biomarcadores moleculares y su relevancia ecológica.
  • Las técnicas más precisas para cuantificación de estrés en ecosistemas acuáticos.

El alumno será capaz de:

  • Obtener información, diseñar experimentos e interpretar los resultados.

Programa de contenidos Teóricos y Prácticos

Teórico

  • Tema 1. Indicadores de estrés en ecosistemas acuáticos: Perspectiva general. Factores de estrés. Sistemas de detección precoz. Criterios de selección de indicadores: Sensibilidad vs Relevancia ecológica. Criterios de clasificación. Exposición vs efecto. Tipos de indicadores: biomarcador, bioindicador, biosensor. Xenobióticos.
  • Tema 2. Biomarcadores Moleculares en organismos acuáticos. Estrés oxidativo: Especies reactivas de Oxigeno (ROS). Defensas antioxidantes: Enzimáticas y no enzimaticos. Métodos de análisis e interpretación de resultados.
  • Tema 3. Estrés térmico: Heat shock protein. Proteasas.
  • Tema 4. Estrés metabólico: razón DNA/RNA. Razones elementales (C:N:P). Metabolismo lipídico y ácidos grasos. Marcadores de actividad respiratoria –técnicas fluorimétrica vs enzimáticas (ETS). Marcadores de integridad de membrana.
  • Tema 5. Indicadores de estrés fotoquímico. Indicadores funcionales de actividad fotosintética. Eficiencia fotosintética: razón Fv/Fm. Producción primaria-14C-incorporación, excreción de carbono. Fotoprotectores.
  • Tema 6. Mecanismos de reparación vs bioacumulación. Efectos sobre organismos. Homeostasis. Compensación vs No-compensación. Umbrales.

Práctico

TEMARIO PRÁCTICO:

  • Integración del temario teórico en las prácticas de laboratorio.
  • Elaboración y exposición de seminarios (grupos reducidos) con los resultados de las prácticas de laboratorio.

PRÁCTICAS DE LABORATORIO:

  • Práctica 1. Técnicas de fluorescencia mediante Pulsos Amplitud Modulada.
  • Práctica 2. Respiración y producción primaria con Optode.
  • Práctica 3. Técnicas fluorimétricas.
  • Práctica 4. Microscopía.

Bibliografía

Bibliografía fundamental

  • Multiple Stressors: A Challenge for the Future. 2007.Carmel Mothersill, Irma Mosse, Colin Seymour. Springer.
  • Understanding Multiple Environmental Stress. 2007. Committee on Earth-Atmosphere Interactions: Understanding and Responding to Multiple Environmental Stresses, National Research Council.
  • Bioassessment of Freshwater Ecosystems:Using the Reference Condition. 2005. Approach Bailey, Robert C., Norris, Richard H., Reynoldson, Trefor B. 1st ed. Corr. 2nd printing, 2005, 184 p., Hardcove.

Bibliografía complementaria

  • Biological indicators of aquatic ecosystems Stress. S. Marshall Adams.
  • Biomarkers and Bioindicators in Monitoring and Assessment: The State of the Art. Peter V. Hodson.
  • Biological monitoring: theory & applications: bioindicators and biomarkers for environmental quality and Human exposure assessment M. E. Conti. WITpress (UK).

Enlaces recomendados

Toda la documentación en formato digital, mensajes y anuncios se gestionarán a través de la plataforma PRADO de la Universidad de Granada, http://pradoposgrado.ugr.es y/o Google App UGR (go.ugr.es)

http://europa.eu.int/comm/environment/water/index.html

http://www.eu-star.at

http://river.bio.auth.gr/labrivers

http://www.epa.gov/ost/biocriteria/basics/

http://www.epa.gov/watertrain/stream_class/

Metodología docente

Evaluación (instrumentos de evaluación, criterios de evaluación y porcentaje sobre la calificación final.)

Evaluación Ordinaria

El artículo 18 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que la convocatoria ordinaria estará basada preferentemente en la evaluación continua del estudiante, excepto para quienes se les haya reconocido el derecho a la evaluación única final.

El sistema de evaluación se describe en el siguiente listado que recoge el porcentaje de evaluación conforme al documento Verifica de la asignatura:

  • Asistencia y participación en actividades presenciales del máster. Ponderación mínima: 10. Ponderación máxima: 10.
  • Exámenes individuales. Ponderación mínima: 50. Ponderación máxima: 50. 
  • Entrega de ejercicios prácticos, cuadernos de prácticas y trabajos individuales. Ponderación mínima: 15. Ponderación máxima: 15.  
  • Entrega de ejercicios prácticos, cuadernos de prácticas y trabajos en grupo. Ponderación mínima: 15. Ponderación máxima: 15.  
  • Pruebas orales. Ponderación mínima: 10. Ponderación máxima: 10.  

Evaluación Extraordinaria

El artículo 19 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que los estudiantes que no hayan superado la asignatura en la convocatoria ordinaria dispondrán de una convocatoria extraordinaria. A ella podrán concurrir todos los estudiantes, con independencia de haber seguido o no un proceso de evaluación continua. De esta forma, el estudiante que no haya realizado la evaluación continua tendrá la posibilidad de obtener el 100% de la calificación mediante la realización de una prueba y/o trabajo.

  • Examen de teoría y prácticas (100% nota final)

Evaluación única final

El artículo 8 de la Normativa de Evaluación y Calificación de los Estudiantes de la Universidad de Granada establece que podrán acogerse a la evaluación única final, el estudiante que no pueda cumplir con el método de evaluación continua por causas justificadas. Para acogerse a la evaluación única final, el estudiante, en las dos primeras semanas de impartición de la asignatura o en las dos semanas siguientes a su matriculación si ésta se ha producido con posterioridad al inicio de las clases o por causa sobrevenidas. Lo solicitará, a través del procedimiento electrónico, a la Coordinación del Máster, quien dará traslado al profesorado correspondiente, alegando y acreditando las razones que le asisten para no poder seguir el sistema de evaluación continua. La evaluación en tal caso consistirá en:

  • Examen de teoría y prácticas (100% nota final)

Información adicional

Parte del material docente de la asignatura estará disponible en formato digital para su seguimiento y consulta de forma asíncrona en la plataforma PRADO de la asignatura y/o en Google Drive (acceso vía cuenta@go.ugr.es).